Estructura organizacional

 El máximo órgano de gobierno del FMCN es la Asamblea General constituida por asociados voluntarios.  Entre sus funciones y responsabilidades están aprobar la composición del Consejo Directivo y los estados financieros anuales, así como modificar y actualizar los estatutos de acuerdo con las necesidades cambiantes del entorno.

 El Consejo Directivo está integrado por 60% de los miembros de la Asamblea. El titular de la dependencia ambiental federal, es miembro ex-oficio de dicho Consejo. Entre otras, sus responsabilidades incluyen la aprobación del plan estratégico, el plan operativo anual con su respectivo presupuesto, y el portafolio de proyectos y programas que serán financiados. Además, el Consejo Directivo nombra al Director General y establece los Comités Asesores necesarios para asegurar la efectiva y transparente operación del FMCN.

 Actualmente el FMCN tiene cuatro Comités Asesores: el Comité de Conservación, el Comité Técnico del FMCN para Áreas Naturales Protegidas, el Comité de Inversiones y el Comité Consultivo Internacional. Los Comités se reúnen periódicamente y ayudan a agilizar los procesos institucionales de toma de decisión. Este mecanismo ha permitido la participación de actores externos que, por su conocimiento en el tema, contribuyen y enriquecen los procesos de discusión interna.

 El equipo operativo está integrado por 27 personas capacitadas y comprometidas con la misión del FMCN.  Está organizado en la Dirección General, dos programas ejecutores de proyectos e iniciativas y un área de finanzas y soporte operativo. Obedece a las decisiones y los mandatos de la Asamblea, el Consejo Directivo y los Comités Asesores.